Pegasus’un çoğunluk payları Esas Holding Anonim Şirketi’ne aittir. Şevket SABANCI ve ailesi tarafından bir girişim şirketi olarak 2000 yılında kurulmuş olan Esas Holding yurt içi ve yurt dışında havacılık, perakende ve eğlence, sağlık, gıda, gayrimenkul ve lojistik sektörlerinde yatırımları bulunan bir holding şirketidir.
Pegasus’un doğrudan pay sahibi olduğu şirketler aşağıda belirtilmektedir. Pegasus’un doğrudan pay sahibi olduğu bir şirket bulunmamaktadır.
| Ticaret Unvanı | Uyruğu / Faaliyet Konusu | Çıkarılmış Sermaye | Nominal Ortaklık Payı | Ortaklık Oranı | Pegasus ile İlişkisinin Niteliği |
|---|
| Air Manas Air Company LLC | Kırgızistan / Tarifeli ve tarifesiz hava taşımacılığı | 12.425.000 KGS | 6.088.250 KGS | %49,00 | Bağlı Ortaklık |
| IHY İzmir Havayolları A.Ş. (IzAir) | T.C. / Tarifeli ve tarifesiz hava taşımacılığı | 59.500.000 TL | 41.125.000 TL | %98,63 | Bağlı Ortaklık |
| Pegasus Uçuş Eğitim Merkezi A.Ş. (PUEM) | T.C. / Simülatör ile uçuş eğitim hizmetleri | 200.000 TL | 98.800 TL | %49,40 | İştirak |
| Hitit Bilgisayar Hizmetleri A.Ş. | Bilişim Sistemleri Çözümleri | 200.000 TL | 100.000 TL | %50 | İştirak |
| Pegasus Havacılık Teknolojileri ve Ticaret A.Ş. | Sentetik Uçuş Eğitim Cihazları Servis ve Eğitim Hizmetleri | 100.000 TL | 100.000 TL | %100 | Bağlı Ortaklık |