Pegasus’un çoğunluk payları Esas Holding Anonim Şirketi’ne aittir. Şevket SABANCI ve ailesi tarafından bir girişim şirketi olarak 2000 yılında kurulmuş olan Esas Holding yurt içi ve yurt dışında havacılık, perakende ve eğlence, sağlık, gıda, gayrimenkul ve lojistik sektörlerinde yatırımları bulunan bir holding şirketidir.
Pegasus’un doğrudan pay sahibi olduğu şirketler aşağıda belirtilmektedir. Pegasus’un endirekt pay sahibi olduğu bir şirket bulunmamaktadır.
| Ticaret Unvanı | Uyruğu / Faaliyet Konusu | Çıkarılmış Sermaye | Nominal Ortaklık Payı | Ortaklık Oranı | Pegasus ile İlişkisinin Niteliği |
|---|
| Hitit Bilgisayar Hizmetleri A.Ş. | T.C./ Bilişim Sistemleri Çözümleri | 300.000.000 TL | 110.446.803 TL | %36,82 | İş Ortaklığı |
| Pegasus Havacılık Teknolojileri ve Ticaret A.Ş. | T.C. / Sentetik Uçuş Eğitim Cihazları Servis ve Eğitim Hizmetleri | 100.000 TL | 100.000 TL | %100 | Bağlı Ortaklık |
| Pegasus Airlines Innovation Lab, Inc. | ABD / Hava yolu taşımacılığında uygulanabilir teknoloji ve yazılım çözüm ve iş birliği fırsatlarının araştırılması | 200.000 $ | 200.000 $ | %100 | Bağlı Ortaklık |